儿童早期矫正和正畸在多个方面存在显著的差异，从定义、原理和方法等方面对比：
儿童早期矫正通常是指在儿童的牙齿和颌骨发育过程中，通过一些矫正手段来预防或矫正牙齿不齐、咬合异常等问题。主要在儿童生长发育阶段早期进行，如乳牙期或混合牙列期，即12岁前儿童颌骨未发育完成时。
儿童早期矫正是利用儿童处于生长发育的潜力，通过干预和引导，帮助儿童及早建立良好的口腔功能习惯，如鼻呼吸、抬舌吞咽等，从而促进颌骨颌面的发育和正常咬合功能的建立。相对灵活，除矫治器外，还包括功能训练、咬合诱导、口腔不良习惯的矫正等。
正畸一般是指牙齿矫正，通过不锈钢托槽、陶瓷托槽等矫正器，对牙齿施加机械力量，将牙齿排列整齐，使其正常咬合。可以在任何年龄阶段进行，但更多集中在恒牙列期，即13岁之后换完牙、颌骨已发育完成的人群。
正畸是依靠矫治器产生的作用力排齐牙齿。对于较重的骨骼畸形，可能需要拔牙或正颌手术等辅助治疗方式，主要通过佩戴固定矫治器、活动矫治器等方式进行矫正。
